[ На главную ] -- [ Список участников ] -- [ Зарегистрироваться ]

Бактерии

  Вход на форум   логин       пароль   Забыли пароль? Регистрация
On-line:  

Раздел: 
Biospeologica Rossica / Микробиология пещер / Бактерии

Страницы: 1 2 Next>> новая тема

Автор Сообщение

Группа: Участники
Сообщений: 310 		Добавлено: 18-10-2010 16:49
Решил начать тему про бактерий. Пока - просто картинки. Это - бациллы из "Снежной", выделены из образца (похоже, грунт из антропогенно загрязнённого участка), присланного Светланой Мазиной (МГУ). Правда, у нас выделились только мезофилы, но зато красивые.

Это 24-часовая культура при +6




То же при +16


То же при +32


Объектив х100, фазовый контраст, масляная иммерсия, линейное увеличение порядка 1200-1500 раз.

Группа: Участники
Сообщений: 403
 Добавлено: 19-10-2010 03:12
Жизнь кипит, а длинные полосы на верхних фото это колонии?

Группа: Участники
Сообщений: 310 		Добавлено: 21-10-2010 20:33
Длинные - это те же бактерии, если кликнуть по превьюшке, то даже видны включения в клетках. Это бациллы, у некоторых видов есть мания в молодой культуре формировать гигантские клетки. Клетка растёт, нуклеоид делится, а клеточного деления не происходит. В результате образуются длинные "многоядерные" клетки, которые потом фрагментируются на кучу мелких.

Группа: Участники
Сообщений: 310 		Добавлено: 23-10-2010 16:51

Группа: Участники
Сообщений: 36
 Добавлено: 26-10-2010 18:56
А вот еще такие красивые колонии образуют бактерии, выделенные из п. Водораздельная

Группа: Участники
Сообщений: 36
 Добавлено: 26-10-2010 19:04
А это профиль этой же колонии

Группа: Участники
Сообщений: 36
 Добавлено: 26-10-2010 19:07
По результатам анализа ПЦР - 100% уровень сходства с Bacillus tequilensis

Группа: Участники
Сообщений: 36
 Добавлено: 26-10-2010 19:15
А это колония бактерий из п. Женевская. Предварительная идентификация – р. Bacillus

Группа: Участники
Сообщений: 310 		Добавлено: 27-10-2010 05:35
"ПЦР", она же полимеразная цепная реакция, это применительно к данному случаю абсолютно неправильный термин. Вошёл в обиход у некоторых красноярских микробиологов в довольно давние годы - говорим "ПЦР", подразумеваем "секвенирование гена 16S рибосомальной РНК".
На научном форуме настоятельно рекомендую использовать правильную терминологию, а то все коллеги убедятся в нашей полной дремучести. Скажут - сразу видно, что авторы недавно вылезли из пещеры...

А почему нет фото по-настоящему интересных изолятов, которые и по 16S, и по температурным оптимумам отличаются от известных видов?

P.S.
Кстати, члены нашего диссертационного совета (по-крайней мере те, кто так или иначе имеет дело с микробиологией) прекрасно знают разницу между "ПЦР" и "секвенированием гена 16S рРНК". И если в докладе прозвучит "ПЦР", они сразу начнут задавать всякие ехидные вопросы.

Группа: Участники
Сообщений: 403
 Добавлено: 27-10-2010 07:40
а у нас вот амплификатор сломался..уже месяц ждем-с когда ж его починят

Группа: Участники
Сообщений: 310 		Добавлено: 27-10-2010 10:28
А у нас и ломаться нечему. Мы заказывали в Перми, Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН. По одному праймеру - 300 руб/штамм, полный сиквенс 16S - 1200 руб. Девчонки заработали денег фитопатологическими анализами в интересах КНИИСХ по заказу Краевого минсельхоза, и частично потратили на генетику, наличкой, не связываясь с бухгалтерией.
В Москве, как я понимаю, народ тоже давно уже не парится с анализами, а заказывает в специализированных лабораториях.


Группа: Участники
Сообщений: 403
 Добавлено: 28-10-2010 02:30
Да слышал, что в Китае можно за копейки сделать анализ, правда вот качество на будет попробовать.

Группа: Участники
Сообщений: 310 		Добавлено: 28-10-2010 12:07
Я сейчас как раз в Китае, в Beihang University, он же Beijing Institute of Aeronautics & Astronautics, по совместному проекту ГФЕН-РФФИ и с лекциями. В прошлый раз выяснил, что генетику студенты делают на лабах (как я понял, амплифицируют и разгоняют, а на секвенирование отдают в специализированную компанию). Если не забду - спрошу, сколько стоит. Хотя нам из Красноярска проще отправлять в российские лаборатории.

Группа: Участники
Сообщений: 403
 Добавлено: 28-10-2010 16:15
Шикарно, Китай экзотика . Сегодня как раз разговаривал со специалистом в Корее стоит 3$ - один образец.
Есть ли жизнь на Марсе

Группа: Участники
Сообщений: 310 		Добавлено: 29-10-2010 08:02
Я надеюсь, что в относительно обозримом будущем комплект оборудования и раходных материалов для рутинных генетических анализов (типа 16S) по цене и простоте работы будет сопоставим с персональным компьютером. По-крайней мере, когда я был студентом, ЭВМ занимали целые залы и требовали присутствия вокруг себя кучи специально обученных инженеров. А сейчас куда более мощная машина стоит у меня на рабочем столе, и доступна даже ребёнку.

Группа: Участники
Сообщений: 403
 Добавлено: 29-10-2010 10:00
Дожить бы, у нас все с отставанием на десяток лет делается, и еще с оглядкой а как там на западе, не дай Бог мы их перегнали

Группа: Администраторы
Сообщений: 31
 Добавлено: 29-10-2010 16:38
Дожить бы, у нас все с отставанием на десяток лет делается, и еще с оглядкой а как там на западе, не дай Бог мы их перегнали

не научные и писссимистические посты будут вытираться

Группа: Участники
Сообщений: 310 		Добавлено: 30-10-2010 18:01
Это не бактерии, а фитопатогенные грибы, против которых успешно борятся пещерные бактерии, см. диссертацию участницы surok.










Группа: Участники
Сообщений: 403
 Добавлено: 03-11-2010 16:12
Хорошие фото, а через что делали. Я так понимаю через какую-то насадку. У меня насадка Zarf..но потом не получается 3D фото сделать..местами нет резкости. Как Вы боритесь с этой напастью?

Группа: Участники
Сообщений: 310 		Добавлено: 03-11-2010 18:24
Снято на микроскопе Микмед-6 вар 3, цифровая камера DCM-130. Там где мелкие фото - объектив х10, линейное увеличение порядка 150. Там, где крупным планом - объективы х20, х40 и х100, линейное увеличение соответственно порядка 300, 600 и 1500. Нижнее фото - фазовый контраст, остальные фото - проходящий свет.
Никаких дополнительных средств не применяли. На большом увеличении (объектив х40 и х100), особенно если препарат не совсем ровный, всё поле зрение резким не бывает, да и не надо. Всё равно на большом увеличении снимаешь не всё поле, а конкретный объект.

Страницы: 1 2 Next>> новая тема
Раздел: 
Biospeologica Rossica / Микробиология пещер / Бактерии

Отвечать на темы в данном разделе могут только зарегистрированные пользователи

Отвечать на темы могут только зарегистрированные пользователи

KXK.RU