|
[ На главную ] -- [ Список участников ] -- [ Зарегистрироваться ] |
On-line: |
Biospeologica Rossica / Микробиология пещер / Бактерии |
Страницы: 1 2 Next>> |
Автор | Сообщение |
sss Группа: Участники Сообщений: 310 |
Добавлено: 18-10-2010 16:49 |
Решил начать тему про бактерий. Пока - просто картинки. Это - бациллы из "Снежной", выделены из образца (похоже, грунт из антропогенно загрязнённого участка), присланного Светланой Мазиной (МГУ). Правда, у нас выделились только мезофилы, но зато красивые. Это 24-часовая культура при +6 То же при +16 То же при +32 Объектив х100, фазовый контраст, масляная иммерсия, линейное увеличение порядка 1200-1500 раз. |
|
amphipoda Группа: Участники Сообщений: 403 |
Добавлено: 19-10-2010 03:12 |
Жизнь кипит, а длинные полосы на верхних фото это колонии? | |
sss Группа: Участники Сообщений: 310 |
Добавлено: 21-10-2010 20:33 |
Длинные - это те же бактерии, если кликнуть по превьюшке, то даже видны включения в клетках. Это бациллы, у некоторых видов есть мания в молодой культуре формировать гигантские клетки. Клетка растёт, нуклеоид делится, а клеточного деления не происходит. В результате образуются длинные "многоядерные" клетки, которые потом фрагментируются на кучу мелких. | |
sss Группа: Участники Сообщений: 310 |
Добавлено: 23-10-2010 16:51 |
surok Группа: Участники Сообщений: 36 |
Добавлено: 26-10-2010 18:56 |
А вот еще такие красивые колонии образуют бактерии, выделенные из п. Водораздельная |
|
surok Группа: Участники Сообщений: 36 |
Добавлено: 26-10-2010 19:04 |
А это профиль этой же колонии |
|
surok Группа: Участники Сообщений: 36 |
Добавлено: 26-10-2010 19:07 |
По результатам анализа ПЦР - 100% уровень сходства с Bacillus tequilensis | |
surok Группа: Участники Сообщений: 36 |
Добавлено: 26-10-2010 19:15 |
А это колония бактерий из п. Женевская. Предварительная идентификация – р. Bacillus |
|
sss Группа: Участники Сообщений: 310 |
Добавлено: 27-10-2010 05:35 |
"ПЦР", она же полимеразная цепная реакция, это применительно к данному случаю абсолютно неправильный термин. Вошёл в обиход у некоторых красноярских микробиологов в довольно давние годы - говорим "ПЦР", подразумеваем "секвенирование гена 16S рибосомальной РНК". На научном форуме настоятельно рекомендую использовать правильную терминологию, а то все коллеги убедятся в нашей полной дремучести. Скажут - сразу видно, что авторы недавно вылезли из пещеры... А почему нет фото по-настоящему интересных изолятов, которые и по 16S, и по температурным оптимумам отличаются от известных видов? P.S. Кстати, члены нашего диссертационного совета (по-крайней мере те, кто так или иначе имеет дело с микробиологией) прекрасно знают разницу между "ПЦР" и "секвенированием гена 16S рРНК". И если в докладе прозвучит "ПЦР", они сразу начнут задавать всякие ехидные вопросы. |
|
amphipoda Группа: Участники Сообщений: 403 |
Добавлено: 27-10-2010 07:40 |
а у нас вот амплификатор сломался..уже месяц ждем-с когда ж его починят | |
sss Группа: Участники Сообщений: 310 |
Добавлено: 27-10-2010 10:28 |
А у нас и ломаться нечему. Мы заказывали в Перми, Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН. По одному праймеру - 300 руб/штамм, полный сиквенс 16S - 1200 руб. Девчонки заработали денег фитопатологическими анализами в интересах КНИИСХ по заказу Краевого минсельхоза, и частично потратили на генетику, наличкой, не связываясь с бухгалтерией. В Москве, как я понимаю, народ тоже давно уже не парится с анализами, а заказывает в специализированных лабораториях. |
|
amphipoda Группа: Участники Сообщений: 403 |
Добавлено: 28-10-2010 02:30 |
Да слышал, что в Китае можно за копейки сделать анализ, правда вот качество на будет попробовать. | |
sss Группа: Участники Сообщений: 310 |
Добавлено: 28-10-2010 12:07 |
Я сейчас как раз в Китае, в Beihang University, он же Beijing Institute of Aeronautics & Astronautics, по совместному проекту ГФЕН-РФФИ и с лекциями. В прошлый раз выяснил, что генетику студенты делают на лабах (как я понял, амплифицируют и разгоняют, а на секвенирование отдают в специализированную компанию). Если не забду - спрошу, сколько стоит. Хотя нам из Красноярска проще отправлять в российские лаборатории. | |
amphipoda Группа: Участники Сообщений: 403 |
Добавлено: 28-10-2010 16:15 |
Шикарно, Китай экзотика . Сегодня как раз разговаривал со специалистом в Корее стоит 3$ - один образец. Есть ли жизнь на Марсе |
|
sss Группа: Участники Сообщений: 310 |
Добавлено: 29-10-2010 08:02 |
Я надеюсь, что в относительно обозримом будущем комплект оборудования и раходных материалов для рутинных генетических анализов (типа 16S) по цене и простоте работы будет сопоставим с персональным компьютером. По-крайней мере, когда я был студентом, ЭВМ занимали целые залы и требовали присутствия вокруг себя кучи специально обученных инженеров. А сейчас куда более мощная машина стоит у меня на рабочем столе, и доступна даже ребёнку. | |
amphipoda Группа: Участники Сообщений: 403 |
Добавлено: 29-10-2010 10:00 |
Дожить бы, у нас все с отставанием на десяток лет делается, и еще с оглядкой а как там на западе, не дай Бог мы их перегнали | |
admin Группа: Администраторы Сообщений: 31 |
Добавлено: 29-10-2010 16:38 |
не научные и писссимистические посты будут вытираться |
|
sss Группа: Участники Сообщений: 310 |
Добавлено: 30-10-2010 18:01 |
Это не бактерии, а фитопатогенные грибы, против которых успешно борятся пещерные бактерии, см. диссертацию участницы surok. |
|
amphipoda Группа: Участники Сообщений: 403 |
Добавлено: 03-11-2010 16:12 |
Хорошие фото, а через что делали. Я так понимаю через какую-то насадку. У меня насадка Zarf..но потом не получается 3D фото сделать..местами нет резкости. Как Вы боритесь с этой напастью? | |
sss Группа: Участники Сообщений: 310 |
Добавлено: 03-11-2010 18:24 |
Снято на микроскопе Микмед-6 вар 3, цифровая камера DCM-130. Там где мелкие фото - объектив х10, линейное увеличение порядка 150. Там, где крупным планом - объективы х20, х40 и х100, линейное увеличение соответственно порядка 300, 600 и 1500. Нижнее фото - фазовый контраст, остальные фото - проходящий свет. Никаких дополнительных средств не применяли. На большом увеличении (объектив х40 и х100), особенно если препарат не совсем ровный, всё поле зрение резким не бывает, да и не надо. Всё равно на большом увеличении снимаешь не всё поле, а конкретный объект. |
Страницы: 1 2 Next>> |
Biospeologica Rossica / Микробиология пещер / Бактерии |